糖尿病(DM)是一種以胰島素分泌或作用缺陷引起的高血糖為特征的代謝性疾病，是心血管疾病的主要危險因素之一。

美國糖尿病學會(ADA)指出，采用醫學營養治療是治療妊娠期糖尿病的有效途徑。研究發現采用DM輔食型營養劑干預與飲食控制相結合的方式可以很好地治療和控制糖尿病，能有效地減少并發癥，防止熱量供應不足，從而降低妊娠期并發癥的風險。

適用于糖尿病人的醫用食品在我國已經得到了較多的使用，目前應用于糖尿病患者的特醫食品有勻漿膳（高纖維型）等。

呼吸系統疾病主要是由于氣管、支氣管、肺部及胸腔病變而引起的一種多發、常見病。臨床上常見的呼吸系統疾病主要有慢性阻塞性肺?。–OPD）、急性呼吸窘迫綜合征（ARDS）、急性肺損傷（ALI）。 

研究發現，在對60例中重度COPD急性期呼吸衰竭病人的分組對照臨床試驗結果中顯示，給予腸內營養支持的治療組與對照組相比，腸內營養支持治療可明顯改善COPD并發呼吸衰竭病人的臨床癥狀和體征，改善肺功能。 

此外特醫食品還應用于慢性支氣管炎、哮喘等其他呼吸系統疾病，研究表明特醫食品可以減緩哮喘癥狀并減少患者對藥物的依賴。

炎性腸病包括潰瘍性結腸炎（UC）、克羅恩病（CD）和一類分類不明確的未確定性腸炎，由于其病變發生在消化道，特醫食品可利用調整飲食結構的方式減輕炎癥性病變，如在食品配方中減少纖維素攝入以及使用易消化吸收的蛋白質和脂肪來源。

《特殊醫學用途配方食品通則》規定，炎腸病病人用全營養配方食品蛋白質來源為整蛋白、食物蛋白質水解物、肽類或氨基酸；脂肪供能比不超過40%。此外，炎性腸病患者常伴有繼發性乳糖不耐受癥，對于這部分患者應選擇去乳糖成分的產品。

研究通過對131例UC患者進行營養支持，結果顯示其體重、白蛋白及總蛋白均明顯增高，同時結果還表明腸內營養能恢復患者的胃腸道生理功能和屏障功能，提高免疫力。

腫瘤是機體局部組織的細胞異常增生與分化而形成的新生物。腫瘤病人營養不良發病率高，患者易出現厭食現象，能量消耗異常，影響腫瘤病人的康復及生活質量。

歐美及中國等腸外腸內營養學會建議通過對腫瘤患者提供營養支持，以降低其并發癥的發生率及死亡率，這一觀點也得到了臨床研究的證明。

在對食管癌患者的營養干預研究中發現，使用了特醫食品的實驗組患者體重和體力狀況評分（ECOG）顯著增長。在對接受放療的癌癥患者給予高蛋白、富含亮氨酸、魚油及低聚糖的醫用食品飲食后也同樣得到了有益的幫助。

特醫食品根據疾病特點或特定人群身體狀況對營養素的需求進行調整，從而滿足目標人群的需求，可以在很大程度上幫助疾病患者改善身體健康狀況。除以上所述，它還廣泛應用在肥胖、腎病、先天性代謝缺陷、輕度阿茲海默癥和難治性癲癇等疾病的營養管理中。

以食代藥進行腸內營養干預可以避免長期服用藥物所帶來的副作用，在一定程度上緩解疾病患者的痛苦，避免某些并發癥的產生，更可有助于患者的康復，縮短住院治療周期，同時減輕患者的經濟負擔。